臍帶血的使用就像一般的器官移植,必須考慮免疫相合的問題,雖然臍帶血移植比骨髓移植的免疫配對較寬鬆,但是由於每個人的組織相容抗原(免疫系統辨認的物質)非常不同,小寶寶的臍帶血與其兄弟姊妹免疫相合的機率是 25%,與其他家人免疫相合的機率就更低,所以未必能用來治療家人的疾病。